《国家宝藏2：秘密之书》的故事主要围绕着林肯刺杀事件展开。尼古拉斯·凯奇这次要寻找的是刺杀林肯的凶手约翰·沃克斯·布斯的结局。1865年4月14日晚，林肯在华盛顿福特剧院遇刺。凶手据称是一个精神错乱的演员———约翰·沃克斯·布斯。据称，在被击毙后，布斯的身旁有一本日记、一把猎刀、两支手枪、一只指南针以及一张关于加拿大的草图。影片就是根据这堆东西展开推理，听上去有点像福尔摩斯在利用推理探案。